STS Polytene Location Q1050 Q1052 iso3 Dm2467 61C1-61C2 catgtccagtTaagatatata catgtccagtAaagatatata catgtccagtAaagatatata Dm0688 61D1-61D2 cttaattccaGattcttgtcc cttaattccaCattcttgtcc cttaattccaCattcttgtcc Dm2739 6.10E+03 ccccgaatttTgttTtacaggatat ccccgaatttTgttTtacaggatat ccccgaatttCgttCtacaggatat Dm2010 62A6-62A10 tcacatattgattg[GAGTTAATG]gcatgggcaata[C]gg[TTTATTCTAGAAAC]tttatagctac tcacatattgattg[GAGTTAATG deletion]gcatgggcaata[A]gg[TTTATTCTAGAAAC deletion]tttatagctac tcacatattgattg[GAGTTAATG deletion]gcatgggcaata[A]gg[TTTATTCTAGAAAC deletion]tttatagctac Dm0890 62A9 taatttacaaTagtTcgccaagcct taatttacaaTagtTcgccaagcct taatttacaaCagtAcgccaagcct Q1050 62B4-62B5 Q1050 Q1052 iso3 Dm3835 62F1-62F2 gcgaacaacaAgctaagccaa gcgaacaacaAgctaagccaa gcgaacaacaGgctaagccaa D1199 63B1-63B8 ctcttttcttTtaatttgcat ctcttttcttTtaatttgcat ctcttttcttGtaatttgcat Dm2200 63D3 ccgcTttcccGccctcggtgg ccgcTttcccGccctcggtgg ccgcCttcccAccctcggtgg Dm2002 63E4-63E5 attttggtacAaatgtggagc attttggtacAaatgtggagc attttggtacGaatgtggagc Dm2068 64D1-64D2 ccggtcagtcCgaggttcatg ccggtcagtcCgaggttcatg ccggtcagtc[-C]gaggttcatg Dm3316 65B4-65B5 gccaaaagtcGcgttgatccg gccaaaagtcGcgttgatccg gccaaaagtcTcgttgatccg Dm0258 65C1-65C2 ccttgttgctCttattatatt ccttgttgctCttattatatt ccttgttgctTttattatatt tggtgctgctTtgtgccacac tggtgctgctTtgtgccacac tggtgctgctGtgtgccacac Dm0262 65C1-65C2 aggatctgtaTgcaccggtaa aggatctgtaCgcaccggtaa aggatctgtaTgcaccggtaa Dm0926 66A1-66A2 tcaagacctgAaaattctatttat tcaagacctgCaaattctatttat tcaagacctgAaaattctatttat cttaccattaAggAttttatgttt cttaccattaAggAttttatgttt cttaccattaGggGttttatgttt gaaccgcatcGagaatcctgc gaaccgcatcTagaatcctgc gaaccgcatcGagaatcctgc ccttcagctaAccggcatcct ccttcagctaGccggcatcct ccttcagctaGccggcatcct Dm0931 66B13-66C2 gcccactgtaCacGttgccgctgt gcccactgtaCacGttgccgctgt gcccactgtaGacAttgccgctgt tggatccccgCggagcagagg tggatccccgCggagcagagg tggatccccgTggagcagagg Dm3667 66C8-66C9 tagtagggctTGaatttggaat tagtagggctTGaatttggaat tagtagggctATaatttggaat Dm0378 66C8-66D2 tttcgggcag[CAAAAAA]3ataacgaaaaa tttcgggcag[CAAAAAA]3ataacgaaaaa tttcgggcag[CAAAAAA]4ataacgaaaaa Dm0631 66E2-66E6 agtgtgacagCtCcaatttatgc agtgtgacagAtTcaatttatgc agtgtgacagCtCcaatttatgc attgactttaaGcaccaatattggaGaggcctatttaagttgTaattaatattttgG attgactttaaAcaccaatattggaCaggcctatttaagttgCaattaatattttgC attgactttaaGcaccaatattggaGaggcctatttaagttgTaattaatattttgG tgttttgcttTAattttAgtacatatttgt tgttttgcttCTattttGgtacatatttgt tgttttgcttTAattttAgtacatatttgt caaattgcacTgagttgggcg caaattgcacAgagttgggcg caaattgcacTgagttgggcg Dm0929 67A1-67A2 taatgcgtttTgtggtacgaa taatgcgtttTgtggtacgaa taatgcgtttAgtggtacgaa Dm2272 67A3-67A4 no SNP no SNP no SNP Dm0947 67B2-67B5 cggacatacAtatgtacatac cggacatacAtatgtacatac cggacatacTtatgtacatac Dm2202 67C10-67D1? agaacatttAccgaatgtaa agaacatttAccgaatgtaa agaacatttGccgaatgtaa Dm1795 67C2 catcgctccaCgaagtcgtgc catcgctccaAgaagtcgtgc catcgctccaAgaagtcgtgc accgagttagTcgggttttct accgagttagCcgggttttct accgagttagTcgggttttct Q1052 68A1-68A2 Q1052 Q1060 iso3 Dm2215 68B1-68B2 tcaGttCctaatttcccTtatcctttcacAaataGaacAttcactttcaacTatt tcaGttCctaatttcccTtatcctttcacAaataGaacAttcactttcaacTatt tcaTttTctaatttcccAtatcctttcacGaataAaacTttcactttcaacCatt cggtggttttTgtgggtcatg cggtggttttTgtgggtcatg cggtggttttCgtgggtcatg Dm2803 68C10-68C1? 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